Diez años han pasado desde el final de Dragon Ball Z. Ub entrena con Goku. Goten y Trunks ahora son adultos, Pan tiene 14 años. Krillin tiene ahora bigote y pelo canoso. Hay paz en la tierra desde la pelea con Majin Boo...
Pilaf después de muchos años finalmente a logrado juntar las esferas del dragón para pedir la dominación de el mundo, Shenlong ya apareció cuando Goku entra en la escena para evitar el deseo de Pilaf, Pilaf al ver a Gokou tan grande después de todos estos años dice que desearÃa que Goku siguiera siendo un niño para que fuera mas fácil vencerlo, Shenlong toma esto como un deseo y Goku vuelve a ser niño, Pilaf sale corriendo y no es vuelto a ver.
Goku regresa Kame House y les cuenta a todos lo que pasó, Mr.Popo aparece y les dice a todos acerca de unas Esferas del Dragon negras, les dice que estas están repartidas en el espacio, Gokou decide ir a buscar estas esferas de el dragón para poder volver a ser grande (las esferas de la tierra solo pueden ser usadas una vez por año). Después Popo menciona que las esferas tienen que ser juntadas antes de que pase un año debido a una desestabilidad de la tierra por la cual dentro de un año explotará!. Goku y Trunks suben a la cápsula espacial, Pan se escabulle abordo sin que se den cuenta y por accidente daña una de las turbinas de la nave espacial. La nave espacial se estrella en diversos planetas. En estos planetas nuestros héroes van juntando las esferas de el dragón, también conocen a una serie de personajes menos importantes (fueron estas escenas las que causaron el desagrado al principio de Dragon Ball GT). Durante estos capÃtulos Goku y Trunks se vuelven Super Saiya por primera vez en Dragon Ball GT para pelear contra Villanos menores. Pan también pelea pero pasa mas tiempo viendo a Goku y a Trunks pelear. Después nuestros héroes conocen a Giru, un pequeño robot que se tragó el radar del dragón por lo cual se une a nuestros amigos en su aventura.