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Es una combinación de algunas características de las ediciones Rubí y Zafiro, Oro y Plata, Cristal, Rojo Fuego y Verde Hoja, pero esta vez la historia ya no se concentrará en los legendarios Groundon y Kyogre, ahora se centra en el legendario Rayquaza. esta edición lleva varias novedades que no han sido vistas en la ediciones Rubí y Zafiro, como partes nuevas que explorar en la región de Hoenn donde se lleva a cabo esta aventura pokemon.

Los personajes fueron re-diseñados, ahora los entrenadores Bruno y Aura llevan nuevos trajes, equipo como la mochila y PokeNav mejorados, que incluya una agenda para almacenar los Nº telefónicos de los entrenadores para hablar con ellos y poder volver a luchar con ellos.

Otra de las innovaciones es el Pokemon Battle Frontier, un desafío parecido a las antiguas torres de batalla, pero con 7 edificios con distintos líderes y distintos retos que pondrán a prueba tu habilidad como entrenador. Pelearás contra legendarios, podrás capturar a Pokemon como Sudowoodo y Smeargle y será un nuevo desafío que rompe la rutina de Pokemon. Una de las innovaciones más interesantes y que más llamaron la atención en Emerald.